使用Ensembl数据库批量下载基因SNP位点信息

使用Ensembl数据库批量下载基因SNP位点信息

技术教程gslnedu2025-03-09 16:39:3512A+A-

1.首先打开Ensembl网站,选择参考基因组(这里以GRCH37为例)

2.输入研究的物种及基因(这里以人BRCA1基因为例)

3. 点击BRCA1(human gene)

4. 点击左侧Variant Table

5. 此时页面就会弹出如下图所示的Table,里面包括了rs号、位点在基因组中的位置、突变频率、临床意义等信息。可以根据自己需要,选择显示内容。

6. 导出数据,点击Table右上方的csv文件即可。



7. 导出后用EXCEL打开,根据自己的研究需要对数据进行筛选。

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