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常用网站介绍|研究RNA与靶基因互作的绝赞数据库:Starbase(五)
上期主要介绍了RBP相关模块的使用方法,本期为starbase最后一期内容,将介绍Pathway和Pan-Cancer两个模块的使用方法。...
02月01日[技术教程]浏览:10
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上海专家发现新的肿瘤免疫抑制受体,可产生广谱抗肿瘤效果
上海专家在《自然》(Nature)杂志最新发表的研究显示,CD300ld靶点有望成为肿瘤免疫治疗新的理想靶点。论文截图。本文图片均为 复旦大学附属儿科医院 供图9月7日,澎湃新闻记者从复旦大学附属儿科医院获悉,2023年9月6日,复旦大学罗敏/卢智刚/高海团队和中国科学院分子细胞科学卓越创新中心赵允...
02月01日[技术教程]浏览:10
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lncRNA功能研究神器:TANRIC数据库
长链非编码 RNA ( Long non-coding RNA, lncRNA 是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,其在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。作为遗传学研究的热点受到了越来越多的关注,最直观的就是每年国自然相关课题的中标情况,可以...
02月01日[技术教程]浏览:11
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掌握这个技能,可以让你的TCGA数据挖掘多发几篇SCI
本文首发于微信公众号SCI狂人,作者为SCI狂人团队,更多资料可以关注微信公众号SCI狂人TCGA是一个非常了不起的数据库,让无数研究生和临床医生可以顺利毕业、升职加薪、申请基金,毫不犹豫地说每一个用TCGA数据发表了论文的人或者课题组都应该好好感谢一下这个数据库。现在利用TCGA数据发的文章呈爆炸...
02月01日[技术教程]浏览:11
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干货来啦!肿瘤生信挖掘必备数据库大合集!看这篇就够了
小伙伴们大家好,肿瘤相关的生信文章绝大多数离不开TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)。但新手小白们可能对这个网站中的数据无从下手,或者仅仅知道寥寥几个相关网站还没能探索到相关的神奇功能。那么,我就来为大家总结一下TCGA生信挖掘必备的数据库合集吧!...
02月01日[技术教程]浏览:14
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别不信!近4分的非肿瘤套路,我用一刻钟零代码就可以复现
从小白的角度,一刻钟复现生信套路。各位小伙伴大家好,这里是美丽专栏。经过两期的零代码复现课,相信大家一定对肿瘤领域的单基因套路有一定的了解,最近也有小伙伴私聊美丽,希望掌握一些非肿瘤领域的生信文章,作为新一代宠粉达人,这样的需求,美丽当然是满足啦。接下来,美丽带大家康康如何在非肿瘤领域进行省心研究,...
02月01日[技术教程]浏览:11
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4个肿瘤数据库,手把手教你生信数据挖掘,不进实验室就把发文章
我们都知道生信发SCI能毕业,能评职称,更能申请基金,而且生信SCI不是meta分析和review综述类,它更是原始数据的加工,你的原始数据可以自己拿去测序的芯片,也可以利用公开数据库的芯片,简单概括就是“拿别人的数据,发自己的SCI!”所以生信数据挖掘套路成了继meta之后又一火热的SCI套路,但...
02月01日[技术教程]浏览:12
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MEXPRESS: TCGA甲基化分析数据库(甲基化cg号查找基因序列)
TCGA数据库是一个包括33种癌的各个组学的数据库。我们通过TCGA数据库可以观察每个人的基因表达的变化;甲基化的变化;拷贝数的变化;以及他们的临床信息。MEXPRESS(https://mexpress.be/ 是一个可视化TCGA数据库当中患者的临床信息—甲基化—表达之间之间关系的数据库。...
02月01日[技术教程]浏览:12